А сколько вариантов вы уже исключили? Под Крон могут подходить до 30 диагнозов (по моим подсчетам, весьма условным).
По гистологии невозможно поставить Крон, если не обнаружена гранулема. Да и она бывает при многих заболеваниях, также как и ее виды.