Добрый день,
Хорошими в Москве считаются НМИЦ им. Рыжих и МКНЦ им. Логинова.
Но вам ещё должно повезти с врачами, которые будут вести и назначать лечение.
Я пока вот прямо таких хороших гастроэнтерологов в Москве не увидел, включая докторов наук.