Спирт конечно нежелательно, но многие действующие вещества, типа полифенолов, кроме как спиртом ничем и не экстрагируешь (варианты вроде хлороформа мы не рассматриваем😁). Обычные дозы настоек - от одной до полчайной ложки, такая доза спирта всосется в верхних отделах ЖКТ, думаю вреда для кишечника не будет. Но в любом случае надо всегда взвешивать возможную пользу и вред.