На самом деле здесь все очень просто.
Например, частная клиника и эндоскопист -
время -деньги, одна манипуляция -также деньги, не обговорили заранее, никто лишнее телодвижение делать не будет.
Как лучше договариваться? На мой взгляд так - берем как минимум 1 фрагмент из каждого подозрительного отдела (где есть воспаление или поражение слизистой) или (оптимально, при подозрении ВЗК) -из каждого отдела кишечника (в том числе из подвздошной) независимо от характера воспаления в нем.
В государственных же учреждениях порой логику нет смысла искать. Порой это может быть -"скажи этому эндоскописту, что наш патологоанатом заколебалась столько фрагментов каждый раз от него исследовать, как-будто другой работы у нее нет". Думаете, нереальная история? Ну, зная нашу российскую медицину на самом деле не такая уж фантастика.
Насколько критично? Для некоторых заболеваний единственная возможность поставить диагноз это как раз заключение морфолога. А в некоторых случаях это просто ни о чем. И такое бывает.