Муцин 2 синтезируется бокаловидными клетками, в которых он подвергается процессингу и хранится в секреторных гранулах до момента секреции, после чего распределяется по кишечному тракту [14, 41].
Однако это распределение неоднородно: в толстом кишечнике имеются два разных по плотности слоя слизи [44], в то время как в тонком кишечнике есть только один рыхлый слой [14]. Внутренний слой толстого кишечника, наиболее твердый и плотный, обладает высокой концентрацией муцина 2. Внутренний слой имеет маленькие поры, что блокирует попадание бактерий в этот слой [43]. Внешний слой рыхлый, является средой обитания комменсальных бактерий [44]