Вам надо «покопаться» в какашках ребёнка. Я бы вложилась. Исследуйте состав микробиоты. Патогены высеяться тоже. Пример секвенирования сюда скину как выглядит
Делают правда долго 2-3 недели.
https://dnkom.ru/upload/iblock/455/ffs3u76z42w990a2psk09eqj9eks8o53.pdf