А лучше сразу иммуноблот. Там по полочкам разложат все антигены. И даже понятно будет патогенная у вас иерсиния или нет. А какой серотип у вас?
По аналогии с туберкулезом - должно показывать. Даже если иерсиния внутриклеточно живет - остатки ее жизнедеятельности покажет ПЦР.