Из-за того, что ваш ребенок на ГВ аутоиммунное появится вряд ли может.
Если вы принимаете препараты, то ГВ лучше завершить и кормить ребенка смесью, препараты как раз могут влиять на ребенка (личный опыт).
А аллергия на белок коровьего молока встречается теперь довольно часто и у детей, чьи мамы не имеют никакого там ВЗК