Доброе утро. Если исключили на две недели, то мог бы быть ложно отрицательный, но не положительный. Может, наоборот, АТ ниже.
Попробуйте про сам анализ спросить в группах целиакий, они опытные в этих вопросах.
Увидеть положительную динамику при исключении глютена на две недели- мало времени, плюс важны и все другие факторы.