Забыл еще:
4) ветвление крипт это морфологический признак "за" няк и против БК
5) по гистологии воспаление в той или иной степени присутствует во всех отделах кишечника- вновь довод в пользу язвенного колита.
Поэтому я больше склоняюсь к нему в Вашем случае.