Из хороших новостей- есть еще врачи, которые назначают и смотрят анализы на дисбиоз (колонофлор, ХМС по Осипову).
В тоже время, можно изначально предполагать и исходить из предпосылок- "есть няк- есть дисбактериоз",
так как ситуация с сильным воспалением, постоянной гибелью клеток, диареей и т.п. к этому располагает.