В статьях, которые я прикрепил (и не только в них), склоняются больше к генетике как к основе.
Это по Крону, по другим заболеваниям не буду говорить, т.к. не узнавал.
Они ведут к тому, что есть наследственность. Но необязательно у кого-то из родственников будет именно Крон, который перейдёт в активную форму, а просто больной кишечник. У меня лично вот этот вариант подходит, т.к. у отца Крона нет, но всю жизнь мучается с кишкой.
Также я встречал данные о генетическом сбое у ребёнка от совершенно здоровых родителей.
В обоих случаях, фактор триггера активной болезни становится наиболее важен.
Но и это всё 100% пока не доказано.