Да, вам необходимо в первую очередь сдать анализы на амебу и шигеллу.
Хотя я и назвал первый вариант приоритетным, но данное описание (если эндоскопист был точен в формулировках) может и отчасти под шигеллез подходить, учитывая пораженный отдел кишечника.