То, что вы описали (неожиданные повторы, реактивации и "самоизлечение") -очень характерны для двух патологий, которые я предположил. Поэтому могу только порекомендовать найти хорошего врача-диагноста и пройти качественное обследование. Получается заново.
Хотя по колоноскопии поражены только левые отделы, что несколько снижает убедительность моих предположений, тем не менее при амебиазе также бывают случаи изолированного поражения прямой и сигмы.
Также я бы рассмотрел вариант пищевой аллергии/непереносимости, так как реализуется она при поражении кишечника различными способами. В приоритете -молочный белок.